恐龙的羽毛还能告诉我们更多事实，例如，恐龙是什么颜色的。如果我们用电子显微镜扫描现代鸟类的羽毛，就能观察到其中有许多小点，它们就是黑素体。黑素体中储藏的黑色素是形成动物不同颜色的主要色素。黑素体有球形、椭球形等多种形态，不同形态的黑素体含有不同的色素。所以只要能分辨羽毛中黑素体的形状，就能确定其颜色。
中華龙鸟是第一种被确定颜色的恐龙
恐龙的羽毛是否也有多种色彩呢？一些古生物学家想到了从一些保存非常好的恐龙羽毛化石（如被火山灰瞬间包裹固化的“中华龙鸟”）中寻找到黑素体。事实证明，恐龙的羽毛中含有多种形状的黑素体，这意味着恐龙有着丰富的色彩：有的是姜黄色，有的是像乌鸦羽毛一样带虹彩的黑色;有的身上分布着斑点，有的尾巴上带有环纹。恐龙和现代鸟类一样绚丽多彩。
