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首先要说专业本身并无好坏之分，选择在任何一个专业领域内做到专而精，那么对你个人来讲，未来的发展都是不可限量的。
其次，电气工程与控制工程两个专业其实算是交叉学科，在各个高校实际招生中，有很多院校专业课科目上，两者专业往往存在交叉，不同院校对专业培养和要求也不尽相同，电气属于强电领域，专业课考察上更侧重电路、电力系统、电路分析等等，而控制则偏弱电，专业课上考察更多是自动控制原理，当然也有考电路、信号与系统等等。
从这一点上，这就要求考生选择自身更擅长的科目，对于提升初试成绩和排名非常有帮助。
然后在就业上，打个比方，电气工程更倾向于前端，科研及一线工作；而控制则偏后端，技术支撑与服务，若是女生的话，建议优先考虑控制。
总之，单纯两个专业对比更多是看两个将来的工作和发展，以及考生自身的专业情况。
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本科自动化，考研电气好还是控制科学工程好？
