1.学历上的差异。三本其实也属于本科，学生们毕业之后可以拿到本科学历；但大专是专科学历，在社会上的认可度远没有本科学历高。紧接着就是学制不同，正如上述所说三本属于本科，所以学生大多数都是4年，甚至有一些专业在4年以上，而专科大多只要3年就可以完成学业。
2.学费不同，三本学校收费要比专科贵很多，从目前情况来看，专科大部分情况下一年的学费只要5000~8000左右，这还算是比较贵的；但如果读三本，普通专业一年的学费都在1万以上，大约在13,000~18,000左右，艺术类专业可能费用更高。
3.教学内容教育目标不同，三本和一本二本一样，侧重于理论基础，致力于将学生培养成优秀的研究型人才，而专科侧重点在于实用性，主要是想将学生培养成优秀的技术性人才。
