二者根本区别是在种子的胚中发育二片子叶还是发育一片子叶，二片的称为双子叶植物，一片的称为单子叶植物。
同时，二者可以从根、茎、叶、花进行区分。
根：双子叶植物的根系，基本上是直系，主根发达；单子叶植物的根系基本上是须根系，主根不发达。
茎：双子叶植物茎内的纤维管束，在横切面上常排列成圆环状，有形成层和次生组织；单子叶植物茎内的纤维管束，为星散排列，无形成层和次生组织，只有初生组织。
叶：双子叶植物叶脉为网状脉；单子叶植物叶脉为平行脉。
花：双子叶植物的萼片、花瓣基数通常是5或者4，没有3基数，即不是3或者3的倍数，花萼和花冠的形状多数完全不同。
单子叶植物的花为两性或者单性，花中的萼片、花瓣的数目通常是3片，或者是3片的倍数。
花萼和花冠较相似。
生活中常见的双子叶植物比如大豆、花生等；单子叶植物如小麦、水稻、玉米、兰花等。
如图：前者双子叶，后者单子叶。
两者都有表皮，叶肉和叶脉，但也有区别： 1.单子叶植物的叶脉为平行叶脉，所含纤维束中不含形成层。
双子叶植物叶脉为网状脉序，在维管束中有时有活动时为短暂而微弱的形成层。
2.单子叶植物叶的表皮组成较复杂，各组分排列有序，在叶尖常有排水器。
双子叶植物叶的表皮一般由单层细胞组成，有的在叶缘具有排水器。
3.单子叶植物叶为等面叶，叶面中的光合组织均由一种细胞构成。
双子叶植物叶一般是异面叶，由于叶片背，腹面寿光情况不同，叶肉分化为近腹面的栅栏组织 和近背面的海绵组织。
