不会被拒绝入境。但前提是你持有日本有效签证，又没有违法情况。
日本签证（Japan visa），是指非日本户籍的人员去日本时要办理的证件，它分为商务签证（短期、长期）、观光旅游签证（个人、团体、家庭型）、探亲/访友签证、访日医疗居留签证、留学签证、持在留资格认定证明书的签证等。
为了提高签发效率，日本使领馆简化了签发手续，并且规定：除外交签证外，其余签证均由日本驻华使领馆指定的代办机构代理，旅游签证由指定旅行社代理，不接受个人申请。
所以在申请日本签证时，申请人须先电话咨询代办机构或旅行社，了解需要准备的具体资料并送交代办机构即可，无须亲自去使领馆排队申请。
扩展资料：
原则上，如果签证申请人具备下列所有条件，符合要求即予以发给签证。
1、申请人持有有效护照，并拥有回国或居住国的再入境权利及资格。
2.、提出的申请资料真实且符合规定。
3.、申请人在日本将从事的活动或身份、地位及停留时间符合出入国及难民认定法（1951年政令第319号，以下称「入管法」）规定的在留资格及停留时间。
参考资料来源：
百度百科-日本签证
