作为一个跟你一样 当初很纠结这两所大学的人 我想说这个问题比较复杂 我就总体上说一说
首先分专业：
举个例子 题主要是想报建筑学、土木专业，而且分数足够高，那必然选同济。
综合来说，同济工科强势，东南相对文理工比较平衡。所以，可以首先看专业排名再说。
其次看地域：
题主如果不是生长在这两个城市，那么我给你比较下。
南京是江苏省会，全省资源供着，而且城市很漂亮，节奏不是特别快，交通状况也还可以。东南大学也坐落在市区比较繁华的位置。
上海地位就不用多说，全国资源都供着，城市节奏快了点，交通可以用糟糕形容，要是去同济在本部还不错，在嘉定那边就惨了。。。
当然 你要是上海宁或南京人，就劝你能在家乡读，毕竟离家近，很舒服。
最后看发展：
东南毕竟是南京最好的两所大学之一，而且就业机会多，所以毕业很容易留下。
同济虽然也是名校，但是在上海文有复旦、工有上交，而理科这两所学校都都压一头，所以第三名确实有点尴尬。不过上海好处是就业机会多，但竞争就很激烈。当然，同济的优势学科很吃香（以建筑和汽车为主），而且和德国交流密切，去德国留学费用少。
不论你选择如何，能否上这两所学校，都祝你有个美好的未来~
（纯手打 请勿转载 最终解释权归答题人所有）
