专业硕士和学术硕士在培养目标，报考条件和学习时长等方面均有所不同。
专业硕士和学术硕士属于同一层次下的学位，但也存在着不同。首先是在培养目标上，专业硕士的培养目标一般是为了从事有着明显职业背景的工作，如工程师，会计师和律师等等，是以专业实践为目标。而学术硕士通常按照学科设立，它的培养目标一般是偏重于理论和研究方面，重点培育的是科研机构和大学老师等。
其次在报考的条件上，一般学术硕士报考条件是本科毕业生及其以上，而专业硕士的范围更为广泛。其次就是在学习的时间长短上，一般学术硕士的时间会长于专业硕士。
