军统和中统区别有：性质不同、主要负责人不同、工作任务不同、管辖领域不同。
性质不同：
中统是国民党中央的情报机构；军统是国民政府军事委员会的情报机构。
主要负责人不同：
中统领导人是陈果夫、陈立夫兄弟；军统领导人依次是戴笠、毛人凤。
工作任务不同：
中统的工作重心是监控国民党机关内部情况、打击一切国民党之外的党派、控制社会舆论和思想；军统主要任务是收集各类情报、对军队监视整治，对敌对势力逮捕暗杀。
管辖领域不同：
军统主要管辖军队、警宪以及各地的交通部门；中统主要管辖的就是国民党的党务问题、全国各地的行政机关以及学校的党务问题，还有社会上的教化舆论。
军统是由蒋介石负责、戴笠和毛人凤领导的、属部队编制的情报组织，主要负责军内情况；中统是由陈果夫和陈立夫负责、归中央统辖的情报组织，主要负责军外情况。中统前期势力大于军统，后来随着蒋介石影响力的提高，军统地位逐渐超过中统。
