49年之前全中国只有一个清华大学。
1949年国民党战败，在兵退台湾之前，蒋介石将国内很多大学的教授、科研人才、实验仪器、科技著作等运往台湾。
这其中就包括清华大学的教授和师生。
清华大学一分为二，北京的清华大学由中华人民共和国政府接管，而台湾当局则于1955年于台湾省新竹市让清华大学复校。
蒋介石政府还把清华大学的校名冠以“国立”，以示其正宗。
台湾清华大学校徽上，写着“自强不息，厚德载物”的校训，该校训与大陆的清华大学是一致的。
其实台湾不仅有清华大学，还有：国立交通大学，与大陆的北京交通大学、上海交通大学、西安交通大学同源。
国立中山大学，与大陆广州的中山大学同源。
东吴大学，与苏州大学（原先也叫东吴大学）同源。
中央大学，与南京大学同源。
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作者：民国史学者、专栏作家王凯清华大学位于北京，这是众所周知的事情，但在台湾新竹也有一所清华大学，这是怎么回事呢？清华学堂成立于1911年4月，是由美国退还的庚子赔款余额创办的一所留美预备学校，第二年改为清华学校；1925年，清华学校增设大学部，此为清华大学之始；国民政府成立后，学校改称国立清华大学，成为中国最著名的高等学府之一；抗战爆发后，清华大学与国立北京大学、私立南开大学一道成立了西南联合大学，搬迁至云南昆明办学，抗战胜利后复员回北平。
1949年后，国民党政府仓皇逃台，国立清华大学图书、设备、人员大部分留在北平，建国后更名为清华大学至今，这就是今天位于北京的清华大学。
清华大学校长梅贻琦已成为一个时代的斯文1955年，美国与台湾签订了原子和平应用协定，大力发展原子科学。
在这个背景下，台湾当局命令原清华大学校长梅贻琦筹备恢复清华大学，并创办原子科学研究所。
在梅贻琦主持下，这所学校沿用了国立清华大学原名，校址设在台湾新竹市。
新竹清华大学1957年开始招收本科生，并逐步扩大招生规模，经过几十年发展，如今已成为与台湾大学、成功大学、交通大学并列的台湾四大名校。
新竹清华大学校园台湾清华大学目前有新竹、仙宫、竹东和宜兰四个校区，学科门类齐全，其中化学、物理、材料科学、工程、计算机科学、生物与生物化学和临床医学等学科在两岸三地名列前茅，在世界上也处于领先地位。
