1、定义区别：四级主办是行政执法类公务员的职级之一， 四级主任科员是综合管理类公务员的职级之一；
2、工作内容区别：四级主办的工作内容主要是依照法律、法规对具体的管理对象进行监管、处罚、强制和稽查，四级主任科员具体从事规划、咨询、决策、组织、指挥、协调、监督及机关内部管理工作。
3、数量区别：四级主办主要集中在公安、海关、税务、工商、质检、药监、环保等政府部门，且只存在于这些政府部门中的基层单位，四级主任科员属于综合管理类公务员范畴，数量非常多，是公务员职位的主体。
总结：
定义区别：四级主办属于行政执法类公务员范畴，四级主任科员属于综合管理类公务员范畴；
工作区别：四级主办的工作内容是依照法律、法规对具体的管理对象进行监管、处罚、强制和稽查，四级主任科员的工作内容是规划、咨询、决策、组织、指挥、协调、监督及机关内部管理工作。
数量区别：四级主任科员的数量要比四级主办的多，四级主办往往只存在于政府特定部门的基层单位。
