1、大小：细菌的大小远比病毒大，通常细菌的大小以微米来衡量，一般通过普通的光学显微镜就可以看到，而且生长条件比较简单;病毒非常小，大小以纳米来衡量。一般需要使用放大倍数的万倍显微镜才可以看到。
2、形态：细菌的外部形态大多为球状、杆状、螺旋状，并且也因此命名为球菌、杆菌以及螺旋菌。而病毒为多面体结构，为了能达到最佳稳定结构，以及最佳比表面积，病毒多位一十二面体。
3、构成：细菌是一种单细胞或者多细胞组成的简单生物，和植物一样都有细胞壁，因此很多杀菌剂就是破坏其细胞核达到杀菌效果;病毒没有细胞结构，是最低等的一种生物的结构，一般只含有一种核酸，通过复制和寄生的方式繁殖。
