范围不一样、开始发行时间不一样、主管公司不一样。
1、范围不一样：岭南通是作百为广东省统一、使用方便、经济实惠的交通智能卡系统。羊城通是广州市公交车电子收费系统，一种电子钱包，是广州市城市交通智能化系统工程（ITS）的相关子系统。
2、开始发行时间不一样：2010年11月08日，广州、佛山、汕尾、肇庆、度江门等五市首批亚运岭南通卡发行。羊城通是2001年12月30日，22、107、270三条公交线路试用羊城通，普通储值3000张。
3、主管公司不一样：岭南通在广东省问委省政府督办和广东省交通运输厅具体部署下，2011年6月28日，由多家企业合作，答正式成立了广东岭南通股份有限公司，以落实推进全省公交一卡通工作，目标是建立全省统一的交通一卡通类银联系统，实现一卡在手、岭南通行，为岭南大众提供便利的公共交通出行服务。羊城通是广州羊城通有限公司（原名：广州交通电子收费营运有版限公司）管理，其成立于1999年，是直属广州市公共交通集团有限公司的国有法人独资企业。
