降雨的强度如果小，不会影响发动机性能和目视条件，飞机就可以飞行。如果降水导致：１、跑道视程达不到最低值。２、跑道面积水超过３ｍｍ。３、有强烈的低空风切变。４、有雷暴，下激暴流或者积雨云等重要天气现象直接影响机场环境，这时候飞机是不能起飞的。
雷电可能损伤飞机机体，影响飞行中的无线电通讯及驾驶舱电子设备的正常工作，进而影响飞机的定位和导航；强风和强降水会造成能见度骤降，低于运行标准，如果发生在着陆阶段，将造成飞机着陆姿态不稳，甚至有可能造成偏离跑道；伴随雷雨产生的不稳定气流会造成低空风切变，在飞机着陆阶段可能造成飞机空速的突增或者骤减，导致飞机机身突然上扬或下冲，严重影响飞行操纵。根据ＩＣＡＯ飞行事故统计，在与低空风切变有关的飞行事故中，有８９。３％是受雷雨天气影响。
除了机场雷雨天气会影响航班运行以外，飞行途径的航路天气也会影响旅客的出行情况。当航路受雷雨天气影响无法正常使用时，飞行员通常采用航路绕飞的方式规避风险；当航路被大面积雷雨覆盖难以绕飞时，出于安全角度考虑，航空公司一般会延误航班，等待天气好转后再执行。
