马克笔的颜料属于油性颜料，因此马克笔的画是无法与水相容，同时，油性颜料的物质密度低于水的密度，导致马克笔的颜料会浮现在水面之上，还有前提条件，需要在瓷器、镜子或光滑不易粘连油性颜料的物体作画，马克笔的画才会分离，形成水面画作。
马克笔的色彩种类较多，通常多达上百种，且色彩的分布按照常用的频度，分成几个系列，其中有的是常用的不同色阶的灰色系列，使用非常方便。一般按照动漫、室内、建筑、服装等不同的种类，有不同的颜色搭配，色彩选择有24色，30色，36色，40色，60色，80色，168色，202色，262色。根据需求的增加，颜色种类已经增至上千种。它的笔尖一般有粗细多种，还可以根据笔尖的不同角度，画出粗细不同效果的线条来
