鱼主要是用鳃呼吸，水流从口流入及有鳃孔流出，在不断通过鳃的时候进行气体交换。因此鱼鳃有着特殊结构。鱼一般有5对鳃弓，内缘是鳃耙、外侧2个比列的鳃片，鳃片由无数的鳃丝排列构成，每条鳃丝又生出许多突起的鳃小片，鳃小片由2曾细胞组成，有着丰富的微血管，是气体交换的场所。相邻的鳃小片交错嵌合，水在其中对流，保证了血液与水之间的最大气体交换量。当鱼离开水后鳃丝和鳃小片就彼此粘连，呼吸面积大大减小，无法补充充足的氧气，且鳃丝暴露在空气中，因水分蒸发引起鳃丝干燥，破坏了鳃的结构，使其失去呼吸功能而死亡。
鱼类是以鳃呼吸、通过尾部和躯干部的摆动以及鳍的协调作用游泳和凭上下颌摄食的变温水生脊椎动物，属于脊索动物门中的脊椎动物亚门，一般人们把脊椎动物分为鱼类（53%）、鸟类（18%）、爬行类（12%）、哺乳类（9%）、两栖类（8%）五大类。根据已故加拿大学者尼尔森在1994年的统计，全球现生种鱼类共有24618种，占已命名脊椎动物一半以上，且新种鱼类不断被发现，平均每年以约150种计，十多年应已增加超过1500种，目前全球已命名的鱼种约在32100种。
