1、大小不同：小茴香的颗粒大，孜然的颗粒小。
2、形状不同：小茴香的颗粒有弯曲，孜然的颗粒弯曲程度不太明显。
3、颜色不同：小茴香颜色浅淡，接近绿色，而孜然颜色更深，为深棕色。
孜然：
孜然又名：枯茗、孜然芹，在南疆则被称为小茴香。为伞形目，伞形科、孜然芹属的一种一年生或二年生草本，高20~40厘米，全株（除果实外）光滑无毛，花瓣粉红或白色，长圆形，花期4月，果期5月。
孜然富含精油，气味芳香浓烈，被认为是继胡椒外世界第二重要的香料作物；孜然也有多种药用特性，能够理气开胃、祛寒除湿等 ，还具有抗过敏、抗氧化、抗血小板聚集和降血糖等保健功效 ，因此得到了国内外学者的广泛关注。
