经典遗传学目前比较公认的是孟德尔，摩尔根提出的基因分离定律，基因自由组合定律，基因连锁互换定律（伴性遗传）。
三大定律基本概括了经典遗传学的主要内容，详细地阐述了基因与生物性状之间的关系，得到了同行广泛的认同。
遗传学也有新的发展，例如新兴的表观遗传学。
这是因为事物认识的发展过程都要经历：肯定、否定、否定之否定的过程。
最开始孟德尔发现豌豆的某些性状是可以自由组合的，是为第一自由组合定律；而后发现了一些反例，有些性状是成对出现，不符合第一定律，于是有第二连锁定律。
最后当染色体结构被发现时，人们发现自由组合和连锁都是由决定两个性状的基因在染色体上出现的位置决定的，并且是极远（包括不在同一对染色体）和极近两种极端情况，在同一对染色体上距离适中的2个基因既不连锁出现，也不完全符合自由分配的比例，于是发明了第三等位交换定律以计算交换概律的办法对基因进行线性排序。
在上世纪末大规模基因测序发明前就是用这种笨办法。
