日本使领馆向前往日本学习的自费留学生签发的签证有两种：一种是4-1-16签证，一种是4-1-16-3签证。
1.4-1-16签证：
对象为申读高等院校的自费留学生，这种学生在日本通常被称为正式留学生，这种签证的居留期通常为1年、6个月或3个月。
申请人取得护照后，具备下列材料就可向日本大使馆申请留学签证。(1)留学理由书、(2)个人履历书、(3)誓约书、(4)填写日本入境签证申请表、(5)经公安机关出具的申请人与保证人关系的证明、(6)申请人最后学校的毕业证书、(7)录取学校的入学通知书、(8)身元保证书、(9)保证人的纳税证明书、(10)申请人的护照和免冠近照5张。
2. 4-1-16-3签证：
对象为自费到日本留学，因语言纯熟程度不符合要求，不能直接升入各大学学习而先进入语言学校学习日语的外国学生(包括其他技艺学校的学生)，他们不是正式留学生。获这种签证的学生，在日居留期限，通常只签半年。在国际学生学院开设的语言学校学习的自费生，也可能获得4-1-6签证.
申请人通过保证人向拟前往的日本语言学校申请入学许可证，由保证人持入学许可证，向入国管理局申请办理"就学事前审查"手续，入国管理局经审核，批准后就发给保证人一份"就学生入国事前审查终了证"，再由保证人寄给申请人。申请人持"学生入国事前审查终了证"和其他手续向公安机关出入境管理部门申请办理出国护照。向日本驻华使领馆索取"入境签证申请表"、"亲属关系表"、"誓约书"。填好使、领馆提供的表格，并书写一份就学理由书、个人履历书。将以上证明材料一并寄给日本驻华大使馆或领事馆办理签证，很快就可得到签证。
