在公共行政学院刚成立的时候，全学院只有20多名学生。当时并没有划分专业，两个系的学生同时学习两个系的课程。到了20世纪60年代，公共行政学院改名为肯尼迪政府学院，并进一步完善了课程设置，开设了政治、经济、历史、统计等专业课程。由于考虑到公务员培训的实际需要，在教学中大量采用了案例教学，并注重培养学员实际解决问题的能力。
经过了几十年的发展，肯尼迪政府学院成为哈佛大学最优秀的学院，其招生的能力已经超过了哈佛大学著名的法学院、商学院和医学院，并且成为美国重要的公职人员培训基地和政府问题研究机构，为美国培养了一大批优秀的公职领导人员，并承担了大量的政府研究课题，对美国社会发展和政府决策产生了巨大的影响。
肯尼迪政府学院的学员有两种类型，一种是全日制的专业研究生，分为三个方向：一个是公共政策硕士(MasterofPublicPolicy)，学制2年；一个是城市和区域规划硕士(MasterofCityandRegionPlanning)，学制2年；再一个就是公共行政硕士(MasterofPublicAdministration)，学制也为2年。另外这三个专业也可以授予博士学位。另一种是在职官员的职业培训，也分为两类：一类是为在职官员授予公共行政硕士学位的培训。这种培训要求政府官员脱产学习1年，通过各种考试后才能拿到学位；另一类是高级行政官员的短期培训教育，培训时间一般为3个星期到13个星期。培训的对象主要是政府机关内部的高级公务员，也包括新当选的国会议员和市长。
