研究生专业的学费也因为公立大学和私立大学类型有所不同。
但是平均来看，私立大学工商管理学硕士专业的学费是RM 21,000-RM 30,000 (US$ 6,560-US$ 9,375)，公立大学工商管理学硕士专业的学费是RM 13,000-RM 25,000 (US$ 4,060-US$ 7,810)。
对于公立大学的非医学研究生专业，每一个的学费大约在RM 1,800-RM 6,000 (US$ 560-US$ 1,875)之间，其他专业课程的费用由学校具体决定。
例如，国际医科大学(私立学校)是按每单元收费，而不是每课程收费，一些硕士学位专业是按照每一个学期来收费。国际学生就读硕士学位专业每单元需要支付RM 2,700- RM 5,300 (US$ 820-US$ 1,610)，论文和研究项目单元费用是RM 21,550-RM 26,750 (US$ 6548- US$ 8128)不等。详细的课程费用以及其他专门研究生专业的费用应该浏览相应大学的官网。
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