1)培养方向不同
根据我国的有关规定，普通硕士教育以培养教学和科研人才为主，授予学位的类型主要是学术型学位;而专业硕士是具有职业背景的硕士学位，为培养特定职业高层次专门人才而设置。
2)考试难度不同
英语课程部分：专硕大部分考英语二，难度较低;考试分数一般专硕比学术低。
3)导师制度不同
专业硕士有两个导师，一个是学术理论指导导师，一个是实践活动指导导师，学术硕士只有前者学术理论指导导师。
4)学费不同
普通硕士按国家规定享受免学费待遇，或者奖学金制度。2014年后国家取消免学费待遇，但奖学金覆盖面比较广，即使收费，学费一般不高于8000元/年，也可以通过申请国家助学贷款或者商业贷款缓解学费压力。
