1、 招生计划归属不同：非全日制专业学位硕士是国务院学位办； 全日制专业学位硕士和全日制同学学术学位硕士由教育部授予。
2、招生对象不同：非全日制专业学位硕士主要面向一定工作年限和经验的在职人员； 全日制专业学位硕士主要面向应届本科毕业生；全日制同学学术学位硕士各类符合条件的在职人员及应届本科毕业生。
3、考生来源不同：非全日制专业学位硕士来源于联考和一志愿报考考生 ；全日制专业学位硕士和全日制同学学术学位硕士来源于统考一志愿和调剂考生。
4、招考时间不同：非全日制专业学位硕士在每年7月份报名10月份考试；全日制专业学位硕士和全日制同学学术学位硕士在每年11月份报名1月份考试 。
5、 录取原则不同：非全日制专业学位硕士的招生由学校自定；全日制专业学位硕士和全日制同学学术学位硕士是统考国家统一分数线。
6、 教学方式不同：非全日制专业学位硕士主要利用双休日和假期教学 ；全日制专业学位硕士和全日制同学学术学位硕士为全日制教学。
7、教学范围不同： 非全日制专业学位硕士按学科领域教学 ；全日制专业学位硕士和全日制同学学术学位硕士按学科领域教学。
8、录取类别不同：非全日制专业学位硕士委托培养 ；全日制专业学位硕士自筹经费、部分院校非定向 ；全日制同学学术学位硕士非定向、定向、委托培养、自筹经费 。
9、授位类别不同：非全日制专业学位硕士授予工程硕士学位证书；全日制专业学位硕士授予专业硕士学位证书、毕业证书；全日制同学学术学位硕士授予学术硕士学位证书、毕业证书。
10、培养侧重不同：非全日制专业学位硕士侧重于学术实践 ；全日制专业学位硕士侧重于学术理论与实践；全日制同学学术学位硕士侧重于学术理论与应用
11、过程管理不同：非全日制专业学位硕士单独管理；全日制专业学位硕士和全日制同学学术学位硕士统一管理，管理制度与学术硕士相同。
