1、专攻方向不同：
学术型硕士平时的主要工作就是研究课题、做实验、发论文，在学术水平上比较擅长；而专业型硕士主要工作是在医院里面进行三年的规范化培训，跟随导师完成一些临床上的工作。
2、毕业有无规培证不同
这也是学术型硕士和专业型硕士最大的区别。专业型硕士由于是偏向临床的，因此在研究生三年期间和规范化培训是同步进行的。也就是说专业型硕士毕业后即可拿到学位证书、学历证书和规范化培训证书。
而学术型硕士在研究生三年期间是无法拿到规培证书的，在毕业后如果需要进入医院岗位工作还需要规培三年拿到规培证才可以。
3、研究生类型不同：
医学考研考学校的属于学术型硕士，而考研考医院的属于专业型硕士，两者类型不同。
4、报考专业原则：
(一)考生须按照与本科毕业专业相关或相近专业进行报考；
(二) 部分专业报考要求：
1、医学临床（学术型）各专业只接受本科为医学专业的学生报考。
2、临床医学及口腔医学硕士专业学位报考要求如下：
临床医学（除精神病与精神卫生学、影像医学与核医学、临床检验诊断学、眼科学和麻醉学以外各专业）只接收全日制本科为五年及以上学制西医临床医学专业的考生报考。
参考资料来源：百度百科—医学专业硕士
参考资料来源：百度百科—学术型硕士
