位于江苏的中国矿业大学校名为中国矿业大学，位于北京的校名为中国矿业大学（北京），2009年以前校名为中国矿业大学北京校区。根据《教育部办公厅关于转发教育部党组会议纪要（2004）第28号有关内容的通知》精神，中国矿业大学保留总校领导班子，中国矿业大学领导兼任中国矿业大学总校领导，两所学校的关系与中国地质大学与中国石油大学不同，近似于山东大学与山东大学（威海）的关系。2009百年校庆后，教育部统一北京校区更名为中国矿业大学（北京），但徐州本部并未发文撤销，在两地共同事务，如科学研究，学科申报等仍以中国矿业大学牵头。
两地自1997年北京校区成立以来，即为不同办学实体，各自独立招生，录取分数线也不同，毕业证分别以中国矿业大学和中国矿业大学（北京校区）（2009年后为中国矿业大学（北京））。
两个学校目前为独立的实体，论正统以徐州中国矿业大学为正统，北京校区为原北京研究生部。中国矿业大学学科较齐全，院士除彭苏萍主要在京，科研机构以煤炭资源与安全开采国家重点实验室 以北京为主外，其他主要在徐州，徐州本科专业60个，北京30个，北京以北研部原采矿等老牌专业为主，其他专业徐州实力较强。徐州为三线城市，北京为首都，考生可以自主选择。
百年校庆 刘延东视察的是徐州，教育部正部长和安监总局正局长也是视察的徐州。
