建筑系设有建筑学和历史建筑保护工程两个本科专业；
设有建筑历史与理论、建筑设计及其理论和建筑技术科学三个专业方向的硕士点和博士点，属上海市重点学科和国家一级重点学科；
可招收博士后，并可招聘长江学者。
拥有本科国家级教学团队1个，国家级精品课程2门，上海市精品课程5门。
二战后，特别是20世纪60年代以来，随着各国对历史文化遗产保护意识的不断增强，历史建筑保护理论和实践的社会影响也在迅速增长，已经成为了人类社会可持续发展的重要组成部分，对此已形成广泛的国际性共识。在美国和一些欧洲国家，历史建筑保护已经成为建筑院系中的一个相对独立的专业领域，属建筑学新兴的学科方向，并且与社会对这一领域的职业化需求相适应。
我国作为历史建筑遗产资源极其丰富的文明古国，有必要在该领域与国际先进接轨，以满足社会日益增长的对此类专门人才的需求。因而2003年经国家教育部批准，在同济大学创立了我国建筑院系中第一个“历史建筑保护工程”本科专业。
本专业着重培养以建筑学的基本理论及技能为基础，系统掌握历史建筑和历史环境保护与再生的理论、方法与技术，具有较高建筑学素养和特殊保护专业技能的建筑师、专家和未来的专业领导者。培养计划汲取欧美的经验，使学生一方面接受整体的建筑学专业本科教育，另一方面接受一定的保护工程特殊训练，以便在毕业后能够适应教学、科研、设计和城市管理等部门的特殊专业需求。
