一、成立时间不同
1、清华计算机系实验班：清华大学计算机科学与技术系成立于1958年。
2、清华计算机系：清华大学计算机科学实验班由姚期智先生主导，创办于2005年。
二、课程设置不同
1、清华计算机系实验班：姚先生融合美国麻省理工、斯坦福和普林斯顿大学的计算机教育的先进方法，专门为姚班精心准备了15门核心课程。
2、清华计算机系：计算机系设有计算机科学与技术与软件工程两个一级学科。其中计算机科学与技术学科属全国首批国家重点一级学科。
该一级学科下包含有计算机系统结构、计算机软件与理论、计算机应用技术三个二级学科，这三个二级学科同样全部为全国重点二级学科，是全国少数拥有全部重点二级学科单位之一。
三、发展方向不同
1、清华计算机系实验班：，42人在姚先生创建的清华大学交叉信息研究院读博，25人在清华计算机系继续深造。
85人赴美国、新加坡、香港和法国等地读研，其中有赴MIT 5人、Princeton 9人、斯坦福大学5人、CMU 6人、耶鲁大学1人、宾夕法尼亚大学3人、哥伦比亚大学6人、UCBerkeley2人等；20人赴MSRA、IBM、Facebook、网易等著名计算机企业工作。
2、清华计算机系：计算机系与政府、众多企业、高校联合成立了多个研究中心，包括普适计算（教育部）重点实验室、媒体与网络技术教育部-微软重点实验室、可视化媒体智能处理与内容安全北京市高等学校工程研究中心。
参考资料来源：百度百科-清华大学计算机科学与技术系
参考资料来源：百度百科-清华大学计算机科学实验班
