各有各的优势，当然也各有弱点。总体来说，浙大的优势更多，更为突出。
如果从学科的覆盖面来说，那么浙大是全国学科覆盖面最广的，南大要差得很远。
从培养模式上说，浙大的培养模式更为先进，并着重对学生的综合能力，提倡学科交叉；南大更注重理论知识和专业素养，因而学风较好，学生专业知识扎实。
从历史文化上，浙大比南大久上那么几年，但更重要的是浙大的求是文化是南大所不能比的。西迁办学更是没有其他任何一个高校可以做到的，这是求是学子最为骄傲的历史。
硬件设施上，那差距就实在是太大了，可以那浙大紫金港和南大浦口对比、浙大玉泉和南大鼓楼对比，两校学生应该都深有体会。
工科、医药、管理、农学等，这些不用比了，南大要比浙大差得远。
文科则是南大要比浙大强的多，虽然浙大有个金庸。
大家都知道南大理科好，其实浙大理科也不弱，尤其是丘成桐带头的数学。南大理科仅次于北大，而浙大仅次于南北二大。
学生的成就、方向不同。浙大有很多校友是各大公司总裁（移动、联通、中石化、颐高等），还有不少著名创业人士（史玉柱等），南大的校友更多的是国内外的教授。
综合来说，浙大确实要比南大要强，浙大前校长潘云鹤院士有着突出的贡献。
