区别：
1.就平均水平而言，公办大学的生源比民办大学的生源要好些。
2.在对学生违纪处分上，公办大学要比民办大学要严厉，处分比较严，相对而言，民办大学会酌情处理。
3.公办大学是官傣式管理，民办大学是精细化、甚至军事化管理，更注重对学生生活的管理。
4.公办大学能拿到文凭，民办大学能学到技能。
5.民办大学的老师更负责。
民办大学系指企事业组织、社会团体及其他社会组织和公民个人利用非国家财政性教育经费，依照国家和本市教育行政部门制定的高等学校的设置标准，面向社会举办的实施高等学历教育的学校或实施高等非学历教育的教育。
公办大学即公立大学。公立大学是国家组建的大学，国家提供部分资金建设。中国的公立大学比私立要好，因为公立大学组建历史悠久，文化底蕴浓厚，有较好的学风，学校策略相对稳定，民办院校其经费来源是由学院的举办方通过各种方式筹集得到，在经费、学费和其他一些相关的管理上也都是按照民办大学的方式进行管理;公办院校其经费全部来自国家拨款。民办高校（大学）指的是企事业组织和事业团体及其他社会组织和公民个人利用非国家财政性教育经费，面向社会举办的高等学校及其他教育机构，其办学层次分专科和本科。国家鼓励社会力量举办实施义务教育的教育机构作为国家实施义务教育的补充。国家严格控制社会力量举办高等教育机构。国家对社会力量办学实行办学许可证制度。各级教育行政部门按照规定的审批权限，对批准设立的教育机构发给办学许可证。
公立大学是指以国家政府或地方政府资助创立维持的大学，区别于以民间资本为主的私立大学。在世界上一些国家和地区（如中国），公立大学可选为重要的研究型大学。而有些国家和地区（如美国）的公立大学则不如许多私立大学具有声望及竞争力。
补充：
中国的民办高等院校与公办高等院校不同，民办高等院校一般由院校所在省、市、自治区的教育厅或教委主管，公办高等院校则由院校所在省、市、自治区级政府主管。
独立学院不属于民办高校的范畴，只是对民办高校的补充，有公立独立学院与非公立独立学院之分。
