日本御茶水女子大学宣布 2020 年 4 月开始，校方将开放跨性别者申请，无论身份户籍上的生理性别是否为男性，只要自认是女性的跨性别者都可以申请，意即以 “心理性别” 作为判断标准。
日本御茶水女子大学则表示，在日本国内 “（接收跨性别者为学生） 2 所国立女子大学中尚属首次，不过私立女子大学方面尚不明确 ”。这项决定是因为接到了当事人等人咨询等情况，因此从 2016 年开始商讨相关事宜。
日本御茶水女子大学在性别问题上，确实一直走得比较前面。1975 年校方就成立全日本第一个妇女资料馆。 此后 1996 年正式改为性别研究中心，除了扩大性别研究的国际领域之外，接下来也在该校的人文科学院建立性别研究的硕士、博士课程。
跨性别者入学在日本高校会是个问题，跟日本有不少女子学校有关。光是大学，全国各地近 50 所。明治维新之后，日本引入了现代教育，但当时男女不平等的情况之下，部分中学、高校不允许女生入学。因此各地开始有人创立女子学校。
在日本，跨性别者如果要办理合法性别变更，必须依据法案 “ 2003 年法律第 111 号” 向家事法庭（家庭裁判所）提出请求。但这项内容除了要求申请人必须是单身状态，没有未满 20 岁的子女，同时经过心理评鉴确诊为 “性别认同障碍”（性同一性障害），还要完成绝育手术。这些严格的规定仍引发争议，一些人权团体也开始积极推动修改法案。
