新能源科学与工程专业在课程内容体系的设置上紧密结合培养目标要求，既注重“厚基础”，突出基本理论与方法，又注重“宽方向”，丰富课程知识结构。注重学生“知识结构”的构建和“能力结构”的形成。
理论部分：在基础教育系列中重点强调基础性与综合性相结合的原则。包括高等数学、概率论与数理统计，线性代数，复变函数与积分变换，大学物理，工程力学，计算机编程语言，机械制图等工程技术基础课群；大学外语、思想道德修养与法律基础，毛泽东思想和中国特色社会主义理论体系概论，中国近现代史纲要，马克思主义原理等社会科学课群。在专业教育系列中重点遵循厚基础、宽口径的原则。包括流体力学、流体机械，传热学、工程热力学，机械设计基础，电工电子学，自动控制理论，能源系统工程、可再生能源及其利用、风力发电原理，太阳能发电与热利用，生物质转化与利用等专业平台课群；光伏材料与太阳能电池、风力发电场，风资源评估等专业选修课群等。
实践部分：重点培养学生的独立思考能力、动手能力和工程实践能力。
