虽然从目前几个主流的国际大学排名和亚洲大学排名看，日本入选高校的整体数量和名次和中国内地的差距在缩小，甚至在某些排名中有被反超。但从实际的教育水平、治学态度、学术风气来说，中日之间还是存在一定的差距的（国内高校的学术生态是一直被国人所诟病）。亚洲目前就学术研究水平来说真正能进入世界顶级大学水准的也就东京大学，再有就是京都大学了。当然，有些排名因为注重国际化师生比例等指标，所以港校等以英文教学为主的高校的名次甚至会高于东大等日本高校，但要是考虑国际核心刊物论文数量和质量、诺贝尔奖获得者等这样的硬性指标，目前在亚洲范围内还是日本高校更有优势。
