学院拥有两个国家重点学科：社会医学与卫生事业管理、流行病与卫生统计学。两个部属国家重点实验室：公共卫生安全教育部重点实验室、卫生部卫生技术评估重点实验室。一个上海市重点学科：流行病与卫生统计学。还有上海市公共卫生重点学科：环境卫生学科、健康促进与健康教育学科、劳动卫生学科、流行病学科、卫生毒理学科。流行病与卫生统计学、劳动卫生与环境卫生学两个学科为复旦大学“985工程”一期重点学科。
学院有复旦大学预防医学研究所、复旦大学医院管理研究所、复旦大学药物经济学研究与评估中心、世界卫生组织职业卫生培训和研究合作中心、世界卫生组织卫生技术评估和管理合作中心。学院为欧洲国际健康研究生教育网络（tropEd）合作成员单位，确定为教育部公共卫生硕士专业学位改革试点单位。
学院现有专任教师97人，其中教授30人，副教授19人，副教授及以上职称的教师比例高于50%。教师中有博士生导师28人，硕士生导师19人。教师中具有博士学位的74人，占教师总人数的76%。有40岁以下青年教师48人，占教师总人数的49%，青年教师中具有硕士及以上学历的比例达到100%。
此外，学院与上海市长宁区、徐汇区、黄浦区、静安区、卢湾区和闵行区6个区的疾病预防与控制中心（CDC）和卫生监督所，以及普陀区CDC等本科生实习基地建立了长期、稳定的合作关系，公共事业管理专业学生有5个专业实习基地，分别是上海市卫生局、徐汇区卫生局、复旦大学附属中山医院、华山医院和华东医院。以上实习基地的带教教师都具有副高以上职称。
2005～2010年学院获得的科研经费为1.69亿元。2005-2010年承担纵向课题1020项。2005-2010年国家自然科学基金面上项目35项；青年项目16项；十一五支撑项目3项；主持“863”项目2项；973项目2项，上海市曙光计划4项；国际合作课题150项。2005～2010年在核心期刊上发表论文1930篇，其中SCI及SSCI收录论文233篇。
