土木工程专业（与香港大学联合培养，仅面向广东省招生）该专业由应用力学与工程系与香港大学土木工程系联合培养。学生第一、二学年在广州大学城就读。原则上前三个学期的所有课程能在第二学年度二月底前通过考试并经香港大学考核合格，并有能力承担香港大学学费和生活费的学生，由香港大学录取，第三、四学年在香港大学就读土木工程专业课程。
除政治理论课和素质教育课外，其它课程的教学及考试均采用英语。学生修满学分、各科考试合格并符合学位条例要求者，中山大学颁发“土木工程”专业毕业证书，香港大学颁发“工学学士(土木工程)”证书。第一、二学年学习结束后未被录取到香港大学土木工程系就读的学生，留在中山大学编入应用力学与工程系“理论与应用力学”专业继续学习，按“理论与应用力学”专业要求培养。
在中山大学学习期间的学费为30000元/年/人，在香港大学学习期间的学费不低于100,000港元/年/人。
