电子工程系原有二个本科专业，即电子信息工程、电子科学与技术。从2005年起，为了适应学科的快速发展和宽口径培养的需要，这二个专业被合并为电子信息科学大类。本系每年招收本科生10个班，约300人。现设有6个博士和硕士点，每年招收博士生约80名，硕士生约170名，另外还在清华大学深圳研究生院招生。除全日制学生外，从1996年起，在企业、研究所和重点部门中招收工程硕士生。该系在校本科生1020人，硕士研究生477人，博士研究生421人。该系现有电子科学与技术、信息与通信工程二个博士后流动站，在站博士后31人。
教书育人是学校的首要职责。电子工程系始终把提高教学质量、培养优秀人才放在首位，不断调整培养方案和教学计划，扩展专业领域，更新专业内容。开设了100余门本科生的专业基础课、专业课和研究生课程，涌现出一批教学质量高、深受同学爱戴的优秀教师，正式出版教材及专著百余部。该系不断组织教师对教学思想、教学内容和教学方法进行讨论，完善课程体系结构，着重专业背景下的通识教育的培养模式，提倡教师引导下学生主动学习的教学方法，加强设计型、研究型、实践型教学内容。
为了加强学生的数理基础，电子工程系加强了与该校物理系、数学系的合作，与数理基础科学班联合招生一个班约30人，旨在提升本科生的数理教学水平，探索现代基础教学的内容和方法。
