山东大学共设31个学院，在117个本科专业招生，各校区学院（部）分别为：
中心校区：哲学与社会发展学院、经济学院、文学与新闻传播学院、历史文化学院、数学学院、物理学院、化学与化工学院、信息科学与工程学院、生命科学学院、环境科学与工程学院、管理学院、马克思主义学院、国际教育学院、经济研究院、儒学高等研究院（山东大学文史哲研究院）、外国语学院大学外语教学部、晶体材料研究所、环境研究院、山东大学齐鲁证券金融研究院
洪家楼校区：政治学与公共管理学院、法学院、艺术学院、外国语学院
趵突泉校区：齐鲁医学部（医学院、公共卫生学院、口腔医学院、药学院、护理学院）
千佛山校区：材料科学与工程学院、机械工程学院、控制科学与工程学院、能源与动力工程学院、电气工程学院、土建与水利学院、体育学院
兴隆山校区：体育学院（除高水平运动员）、信息科学与工程学院（一二年级）、经济学院（一年级）、管理学院（一年级）、法学院（一年级）、政治学与公共管理学院（一年级）
软件园校区：软件学院、计算机科学与技术学院、加拿大高等教育基础部
山东大学（威海）：韩国学院、商学院、法学院、新闻传播学院、翻译学院、艺术学院、海洋学院、机电与信息工程学院、空间科学与物理学院、继续教育学院、数学与统计学院、国际教育学院
山东大学（青岛）（计划2016年搬迁）：信息科学与工程学院、生命科学学院、计算机科学与技术学院、环境科学与工程学院、政治学与公共管理学院、法学院
