邓肯在大学待满了四年。在这段时间内，他两获ACC联盟年度最佳球员，连续三年拿到全美篮球教练协会最佳防守球员奖，他在1995-97年连续三年打入NCAA锦标赛，在1995-97年连续三年进入ACC联盟第一阵容，在1996年当选ACC联盟锦标赛最有价值球员，此外，在1996年他还在得分、篮板、命中率和封盖四项统计上都名列ACC联盟第一，成为联盟历史上首位同时名列这四项技术统计头名的第一人。
总计四年中，邓肯率队取得97胜31负的成绩，他在毕业时的封盖总数名列联盟历史第二，仅次于高露洁大学的阿多纳尔-福伊尔，还是NCAA历史上仅有的10位拿下2000分、1500篮板以上技术统计的球员之一，还是NCAA历史上第一位拿到至少1500分、1000篮板、400封盖和200助攻的球员。他毕业时留下了创造ACC联盟历史纪录的481次封盖，总共1570个篮板也排名ACC联盟历史第三位。
在拿到了大学学位之后，邓肯终于宣布参加1997年NBA选秀。
