鱼在水中能够通过呼吸进行新陈代谢，主要是它拥有一个重要器官——腮。
鳃是专门适应水中呼吸的构造。
鱼的咽喉两侧各有4个鳃，每个鳃又有鳃片和鳃丝组成。
呼吸时，鳃片和鳃丝完全打开，会增大鳃与水的接触面积，增加与水中溶解氧结合的机会。
鱼在水中，嘴巴一张一闭的进行呼吸；它张嘴时，把水吸入，鳃盖关闭，闭嘴时，鳃盖打开，让水流出。
在水流经腮的过程中，水中的溶解氧就被鳃上的微血管吸收，同时把二氧化碳排入水中，鱼只要一旦离开水，它的鳃片、鳃丝粘合重叠在一起，不能及时得到氧而窒息。
还有一种特殊的鱼，肺鱼。
它是一种和腔棘鱼类相近的淡水鱼。
古代时曾在地球上大量 繁殖，现在仍有少数保存着其种族而遗留下来，可以说是一种“ 活化石”。
颌为自接式，平时用 鳃呼吸，在干涸时可以用鳔当作肺呼吸，鳔在食道处有一开口，可以叫做内鼻孔，背鳍、 臀鳍和尾鳍愈合在一起，颌上没有硬骨，有特殊的齿板。
肺鱼在 软组织的构造、发育、生理和行为方面有许多性状与现生两栖类接近而不同于其他现生鱼类，例如美洲肺鱼具有以声门与食道相接的双肺，鳃及鳃部血管较退化， 心脏具二心室，其一接受来自肺部的血液，动脉锥有瓣膜将来自肺部的血液与来自鳃部的血液分开。
不久前，有些学者提出，肺鱼在具有会厌软骨、 脑下垂体结构及其激素成分、 晶状体蛋白、 胆汁盐、鳃弓肌肉等方面亦与现生两栖类最为接近。
首先，感谢题主的邀请，谢谢！大家都知道鱼儿是应该在水下呼吸的，那么本来应该在水下呼吸的生物为什么跑到水面呼吸了呢？当然是因为水下的氧气不足啦，空气中的氧气比水中氧气的含量要高的多，所以鱼儿就跑至水面啦。
一般的发生这种情况的原因就是水质恶化或者鱼儿养殖密度大造成的。
还有一种情况，就是水质清新，鱼儿照样在水面呼吸。
这就可以说明鱼儿的呼吸器官出了问题，就是鱼鳃犯病了，大部分都是细菌性炎症，用点消炎药就好啦。
最后一种情况是，有些鱼本身就可以在水面呼吸，比如清道夫，斗鱼，曼龙鱼之类的，他们在水中也很少会发生缺氧的情况，这类鱼是要区别对待的！
