查理大学包含17个学院百：
-天主教神学学院
-新教神学院
-胡斯教派神学院度
-法律学院
-第一医学院
-第二医学院
-第三医学院
-Plzeň医学院
-Hradec Králové医学院
-药剂学学院in Hradec Králové
-哲学学院
-自然科学回学院
化学学院，生物学院，地理与地质学院，环境科学学院
-数学答和物理学院
物理学院，数学学院，计算机科学学院
-教育学院
-社会科学学院
经济研究学院，传播与新闻学院，国际研究学院，政治学院，社会研究学院，
-体育运动学院
-人文科学学院
