植物分类学是植物学科中最古老和最具综合性的一门分支学科。过去的经典分类大多依据外部形态和内部解剖特征去分，后来把孢粉形态、地理分布和古生物学等方面的内容结合进去后，有助于进一步对种类的鉴定、植物演化关系的探讨和植物的分类。
现存于地球上的植物，估计约为50余万种，整个植物界通常被分为16门。
1． 裸藻门Euglenophyta
2． 绿藻门Chlorophyta
3． 轮藻门Charophyta
4． 金藻门Chrysophyta
5． 甲藻门Pyrrophyta 藻类
6． 褐藻门Phaeophyta （spore plant） 植物
7． 红藻门Rhodophyta 隐花植物 低等植物
8． 蓝藻门Cyanophyta （孢子植物） （无胚植物）
9． 细菌门Bacteriophyta
10． 粘菌门Myxomycophyta 菌类
11． 真菌门Eumycophyta 植物
12． 地衣门Lichens
13． 苔藓植物门Bryophyta
14． 蕨类植物门Pteridophyta （seed plant） 颈卵器植物 高等植物
15． 裸子植物门Gymnospermae 显花植物 维管植物 有胚植物
16． 被子植物门Angiospermae
