应该没有什么问题。只要你英语真的很擅长就算日语不好，日本大学的老师也会考来虑你的。对于你的情况无论是转专业还是升研应该都不自是问题。相对升研，对于教授来说你的英文能力很有利。
首先选择大学，然后根据大学的要求准备材料。报考大学。日本大学一般都会在国内百准备考场。只要你日语3级，对于一般大学来说应该不是问题。对留学生来说，材料和面试时的印象与口语是最重要的。
相对升研就比较不一样。虽然要求要低。但是要用日语，最好再加度英语的材料与论文发给招收研的教授。然后等待答复。但是里面有一个另类的诀窍。一是，发给多位教授。二是一些著名大学的“名誉”教授招收学生的要求知会比较低，对
留学生也有兴趣.
对于具体的材道料步骤与程序一定不要马虎。因为每一个学校都是不一样，一定要多查资料。
祝你升学成功
