百草枯和草甘磷都属于灭生性除草剂，只是作用机理不同，除草效果也有所不同。
1、百草枯是触杀型除草剂，杀草速度比较快，一般施药后三个小时就能看到效果，但是只能杂草的叶子，百草枯遇土钝化不能除根，而且对人畜剧毒无可救治现在已禁止使用。
2、草甘磷是内吸传导型除草剂，药物喷到杂草上，杂草叶片通过光合作用吸收以后，传导到杂草的根部杀死，使杂草不能生长而死亡，具有死根的除草效果，草甘磷在土壤中有残留期，要适当掌握使用浓度，以防影响下荏作物生长。
这两种除草剂使用时都不能喷到农作物上，以免使农作受药害而死亡。
两种农药针对杂草效果都很好，只是百草枯对人也剧毒，有拿它自杀的所以被淘汰掉了，而草甘膦属于低毒农药，加之农残转少，仍在大量使用。
