2007年10月31日，正在日本参加国际会议的我校常务副校长叶取源教授前往日本北九州市，代表上海交通大学与北九州市、财团法人北九州产业学术推进机构（FAIS），三方共同签订了促进学科与人才交流的协议。
协议主要内容是上海交通大学在北九州学术研究园区建立研究分室，与北九州市和FAIS进行三方合作，对信息技术与环境保护进行共同研发。北九州市每年提供一千六百万日元资助该项目。此次在早稻田大学的帮助下，我校在北九州学术研究园区设立研究室。这预示着我校与早稻田大学将会有进一步的合作。
2006年8月，基于上海交通大学与早稻田大学的校际交流协议，我校电子信息与电气工程学院与早稻田大学研究生院信息生产系统研究科签订了关于学术交流的备忘录。同年11月，双方又签订了详细的备忘录附则。2007年9月18日，我校精心选拔出的9名优秀生踏上了前往早稻田大学攻读双硕士的路途。目前，通过在早稻田大学的学习，他们在各方面都获得了很大的进步。
