1、内、外回流比生物反硝化系统外回流比较单纯生物硝化系统要小。
2、反硝化系统污泥沉速较快。缺氧区溶解氧DO过高。
3、温度调控不当，当低于15℃时，反硝化速率将明显降低，至5℃时，反硝化将趋于停止。
4、BOD5/TKN因为反硝化细菌是在分解有机物的过程中进行反硝化脱氮的，所以进入缺氧区的污水中必须有充足的有机物，才能保证反硝化的顺利进行。
5、污泥负荷与污泥龄由于生物硝化是生物反硝化的前提，只有良好的硝化，才能获得高效而稳定的的反硝化。因而，脱氮系统也必须采用低负荷或超低负荷，并采用高污泥龄。
