主要区别是科目分类不同、生活习性不同、外形特征不同。
千足虫是一种陆生节肢动物。它体形呈圆筒形或长扁形，分为头和躯干两部分，头上长有一对粗短的触角，身体最多有几百节。除去第一节无足和第2-4节是每节一对足外，其余每节有两对足。千足虫虽然没有毒，但它也有防御的武器和本领。收到危险会蜷缩，静止不动，等危险过了才会伸展开来爬走。千足虫体节上有臭腺，会分泌出臭液，气味难闻，使得家禽和鸟类都不敢吃它。
蜈蚣是节肢动物。身体又长又扁，黄色的头上长了一对细长的触角和一对单眼，嘴是由一对大颚和一对小颚组成。背面是暗绿色，腹部是黄褐色，足上有发达的爪和毒腺，最后一对向后延伸像是尾。蜈蚣习惯生活在腐木缝隙之间，行动十分敏捷，晚上会外出捕食小动物，白天在缝隙里不会出来。
