花土沟属于青海省海西蒙古族藏族自治州茫崖市。地处茫崖市东部，东与冷湖镇接壤，南接格尔木，西与茫崖镇相连，北与新疆维吾尔自治区若羌县相邻。
花土沟镇的主要河流有阿拉尔河，发源于西南山前的潜流地，年平均径流量总计9290立方米。有大小湖泊10余个，较大的咸水湖有尕斯湖和茫崖湖。花土沟镇属大陆荒漠区气候类型。
年平均气温3.8℃;最热天气为7月，平均气温18.5℃，极端最高气温30.6℃;最冷天气为1月，平均气温-12.4℃，极端最低气温-25.3℃。年降雨量44毫米。年大风天气为125天以上，多为西北风且多为8级以上大风，年平均风速3.1米/秒，最大风速22.3米/秒。年日照时数3173.2小时，日照率72%，无霜期为90天。
