脱脂牛奶和全脂牛奶主要是加工方式、味道、营养和适用人群的区别。加工方式上，脱脂牛奶是加工去除脂肪，全脂牛奶就是普通牛奶，只经过初加工；味道上，全脂牛奶更有奶味儿，更香醇；营养上，脱脂牛奶因为脂肪含量低，所以它的热量比全脂牛奶降低了45%，胆固醇含量也比全脂牛奶降低了70%以上，但是脱脂牛奶的钙含量、蛋白质含量与全脂牛奶相比相差不大；适用人群上，脱脂牛奶更适用于低脂肪摄入者，如中老年人和减肥的人。全脂牛奶适用于各个年龄段的人，尤其是正处于生长发育期的儿童。
虽然脱脂牛奶脂肪含量低，但这并不能代表它是不好的。因为影响健康的关键并不在于喝脱脂牛奶还是全脂牛奶，整个饮食结构对健康的影响是更具有决定性的，如果食物中的饱和脂肪比较多，那么喝脱脂牛奶也不失为减少脂肪摄入的好办法。
