南京大学与燕山大学根本不在一个层次上，提出这样的问题毫无意义。
不过还是感谢网友的焦作，简单地为邀请人回答一下，对比一下南京大学和燕山大学的具体实力，看看他们的差距有多在。
南京大学南京大学是中国最顶级的大学之一，是中央直管、教育部直属的985工程大学、211工程大学和双一流建设A类大学。
中国最强高校联盟C9成员高校之一，网友们也把他和上海交通大学、复旦大学、浙江大学、中国科学技术大学并称为“华东五校”。
南京大学最早的起源是1902年创建的三江师范学堂，在其发展过程中，曾经有过非常辉煌的一页。
国立第四中山大学、国立中央大学、国立南京大学等都是他曾经使用过的校名，曾经是亚洲排名第一的高校。
不过在建设后，上个世纪50年年代原南京大学被惨烈的分拆，现在的东南大学、西北工业大学、空军军医大学、河海大学、南京师范大学、南京林业大学、南京信息工程大学、江南大学、南京工业大学、江苏大学、华东政法大学等院校，都曾得到过南京大学拆分出来的部分专业或院系。
南京大学当时得到了金陵大学的文理类专业。
不过南京大学现在仍然是江苏省第一高校。
批四轮学科评估时有44个学科评级上榜，其中A类学科21个。
具体评级如下：二、燕山大学燕山大学的起源是哈尔滨工业大学，他相当于哈尔滨工业大学的一分支。
1958年哈尔滨工业大学重型机械系及相关专业整体迁至齐齐哈尔市，组建了哈尔滨工业大学重型机械学院。
1960年独立更名为东北重型机械学院，隶属于原机械工业部直属高校。
1978年确定为全国重点高等院校。
1985年至1997年学校整体南迁秦皇岛市，同时更名燕山大学。
1998年，由原机械工业部划转到河北省，实行中央与地方共建，以河北省管理为主。
燕山大学的最强势的专业是机械类，当年燕山大学与吉林工业大学（已并入吉林大学）、合肥工业大学、湖南大学全称为为“机械四小龙”。
不过对于河北省来说，燕山大学再好也是一个继子，半路迁址到了河北省，而且只是在一个普通地级市落脚。
当年评选211工程大学他就没有拿到河北省的名额。
虽然现在有网友推测他会成为下一轮一流学科建设高校，但是他的整体实力并不算强，成为“一流学科建设高校”还是有很大差距的。
下图是燕山大学第四轮学科评估结果，其中机械工程学科是他唯一的A类学科。
最后结论，南京当然更好。
燕山大学与南京大学的差距很大，燕山大学还要努力。
你不如问“北京理工大学和保定理工学院哪个更好？”好歹都有理工俩字
