保税区和免税店的区别在于：保税区就是在海关监管下可以较长时间存储商品的区域，是我国目前开放度和自由度最大的经济区域。外国商品存入保税区的保税仓库，不必缴纳进口关税，可以自由出口，只需交纳存储费和少量费用，但如果入境则需交纳关税。而免税店是指贩卖免税金或关税商品的零售商店。免税商店通常设置在国际机场、国际港口以及邮轮内，鲜少设置于公路或火车旁。
拓展：
目前，我国境内的免税店主要有口岸免税店、运输工具免税店、市内免税店、外交人员免税店、供船免税店及我出国人员外汇免税商店。
免税商店供应对象主要有因公出国人员、远洋海员、华侨、外籍华人、港澳台同胞、出国探亲的中国公民及在国内的外国专家等。
特点：免税，特别是奢侈品免税，价格比市面上便宜很多。
