新疆的沙漠很多，其中比较大的十个有库木库里沙漠、鄯善库姆塔格沙漠、布尔津—哈巴河—吉木乃沙漠、阿克别勒沙漠、塔克拉玛干沙漠、古尔班通古特沙漠、罗布泊南库姆塔格沙漠、乌苏沙漠、福海及乌伦古河沙漠、霍城沙漠。
新疆塔里木盆地的塔克拉玛干沙漠是中国最大的沙漠。塔克拉玛干沙漠东西长约1000公里，南北宽约400公里，面积33万平方公里。它是世界上仅次于非洲撒哈拉沙漠的第二大移动沙漠。
库木库里沙漠是世界上海拔最高的沙漠。库库里沙漠面积1600平方公里，呈不规则矩形，位于奇曼塔格山与丘鲁皮蒂勒切山、丘拉切山之间，海拔3900 - 4700米。主要由高高的金字塔形沙丘、复合新月形沙丘和新月形沙丘链组成。
