近亲结婚会对孙子有一定的影响。近亲结婚，后代的死亡率高，并常出现痴呆、畸形儿和遗传病患者。这是由于近亲结婚的夫妇，从共同祖先获得了较多的相同基因，容易使对生存不利的隐性有害基因在后代中相遇(即纯合)，因而容易出生素质低劣的孩子。
近亲结婚的孩子早期死亡率和畸形率比较高。近亲结婚的后代体质会比较差，体重较轻，身高较矮。在孙子那一代出现遗传疾病的概率也会大大的超过非近亲结婚的。人们从无数事实中认识到血缘关系近的男女结婚，后代死亡率高，常出现痴呆、畸形和遗传病。这是因为近亲结婚的夫妇，从共同祖先那里获得了较多的相同基因。
近亲结婚会大大提高隐性遗传病的概率。近亲结婚后代的隐性遗传病将是非近亲结婚后代隐性遗传病的150倍。据调查，近亲结婚的后代所患的先天性心脏病、无脑儿、脊髓裂变等多基因病的发病率约为1.64%，高于非近亲结婚子女的0.57%。高血压、精神分裂症、癫痫等多基因遗传病，在近亲结婚所生子女的发病率明显高于非近亲结婚。
